<div dir="ltr"><div><div><div>Dear Daryl,<br><br></div>sadly, I do not have any experience with PDXL so I am unsure if raw CIF files can be directly imported to be used for phase identification.<br></div>However, Rigaku have provided us with a precompiled index file that can be used for this purpose. Instructions on how to install it as well<br></div><div>as the index file itself can be acquired here: <a href="http://www.crystallography.net/cod/archives/2016/Rigaku">http://www.crystallography.net/cod/archives/2016/Rigaku</a>.</div><div><br></div><div>I will send this reply back to the 'cod-bugs' mailing list in case my colleagues have some additional comments. Please inform us of your progress.<br><br></div><div>Sincerely,<br></div><div>Antanas Vaitkus<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, 20 Sep 2019 at 18:53, Darryl Borland <<a href="mailto:darryl.borland@unibas.ch">darryl.borland@unibas.ch</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">





<div lang="EN-US">
<div class="gmail-m_6988327623662937139WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Hi Antanas,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)">We downloaded the following
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><img id="gmail-m_6988327623662937139Picture_x0020_1" src="cid:16d4f8d16484cff311" width="573" height="44"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)">We are using PDXL on our Rigaku XRD.    Are there any installation guidelines?   We are trying to import the CIF files this seemed to work but I think we might
 be doing something wrong.  If you have any info that we read for next week that would be great.
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Have a nice weekend,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Darryl<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><a name="m_6988327623662937139__MailEndCompose"><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></a></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:11pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> Antanas Vaitkus [mailto:<a href="mailto:antanas.vaitkus90@gmail.com" target="_blank">antanas.vaitkus90@gmail.com</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Friday, September 20, 2019 3:00 PM<br>
<b>To:</b> Darryl Borland <<a href="mailto:darryl.borland@unibas.ch" target="_blank">darryl.borland@unibas.ch</a>><br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:cod-bugs@ibt.lt" target="_blank">cod-bugs@ibt.lt</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [Cod-bugs] COD<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12pt">Dear Darryl Borland,<u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12pt">thank you for your interest in the COD. Yes, an offline version of the COD can be acquired in multiple ways<br>
which are described on the following page: <a href="http://wiki.crystallography.net/howtoobtaincod/" target="_blank">
http://wiki.crystallography.net/howtoobtaincod/</a>.<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12pt">Please let us if you have any additional questions or if you encounter any problems while retrieving the files.<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Sincerely,<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Antanas Vaitkus<u></u><u></u></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On Fri, 20 Sep 2019 at 15:44, Darryl Borland <<a href="mailto:darryl.borland@unibas.ch" target="_blank">darryl.borland@unibas.ch</a>> wrote:<u></u><u></u></p>
</div>
<blockquote style="border-color:currentcolor currentcolor currentcolor rgb(204,204,204);border-style:none none none solid;border-width:medium medium medium 1pt;padding:0in 0in 0in 6pt;margin-left:4.8pt;margin-right:0in">
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Good afternoon,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">I do not have much experience with COD and XRD for that matter, but I am learning.  For security reasons in our department at the University we do not have our computer on the network
 only intranet for data storage etc.   Is it possible to have an offline version of the COD?  
<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Thanks again and I apologize for the dopey questions.
<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Darryl<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><img id="gmail-m_6988327623662937139gmail-m_3350534346232585797Picture_x0020_1" src="cid:16d4f8d16485b16b22" alt="https://pharma.unibas.ch/fileadmin/pharma/images/logo-institute.png" width="200" height="68" border="0"><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Basel University<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Dept. of Pharmaceutical Technology<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">50 Klingelbergstrasse<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">CH-4056 Basel<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">+41612071502<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal">_______________________________________________<br>
Cod-bugs mailing list<br>
<a href="mailto:Cod-bugs@lists.crystallography.net" target="_blank">Cod-bugs@lists.crystallography.net</a><br>
<a href="http://lists.crystallography.net/cgi-bin/mailman/listinfo/cod-bugs" target="_blank">http://lists.crystallography.net/cgi-bin/mailman/listinfo/cod-bugs</a><u></u><u></u></p>
</blockquote>
</div>
<p class="MsoNormal"><br clear="all">
<br>
-- <u></u><u></u></p>
<div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Antanas Vaitkus,<u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal">PhD student at Vilnius University Institute of Biotechnology,<br>
room V325, Saulėtekio al. 7,<br>
LT-10257 Vilnius, Lithuania<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12pt"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div>Antanas Vaitkus,<br></div>PhD student at Vilnius University Institute of Biotechnology,<br><span><span><span>room V325, </span></span></span>Saulėtekio al. 7,<br>LT-10257 Vilnius, Lithuania<br></div><div><div><div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><br><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>