<div dir="ltr"><div>Thanks Saulius,</div><div><br></div><div>Apologies. As you suggested, I tried from another location and rsync seems to be working fine. I've turned the firewall off on my machine so it looks like it is being blocked higher up.<br></div><div><br></div><div>Regards,<br></div><div>- Noel<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, 9 Jul 2020 at 15:23, Saulius Gražulis <<a href="mailto:grazulis@ibt.lt">grazulis@ibt.lt</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi, Noel,<br>
<br>
sorry to hear that you have problems fetching the COD.<br>
<br>
I have just tried the commands on my machine and the commands from the<br>
documentation that you cite work.<br>
<br>
The "connection refused" indicated that your program (client) could not<br>
reach the necessary port on the COD server.<br>
<br>
Possible reasons:<br>
<br>
- your internet provider (university?) block the necessary ports for<br>
outgoing connections, except http(s)...<br>
<br>
you can check port blockage in several ways:<br>
<br>
a) by using rsync to other sites (e.g. PDB) from the same computer;<br>
<br>
b) by using rsync to the COD site from *another* computer that is less<br>
likely to be blocked;<br>
<br>
c) by using nmap to see what ports are open on the COD server from your<br>
computer.<br>
<br>
- somehow the IP number you are using ended up in a blacklist (although<br>
we should only blacklist the IPs that try to guess ssh passwords, not<br>
the rsync/svn users...). Could you please let us know which external IP<br>
number you are using?<br>
<br>
Of course you are always welcome to fetch the archive or download via<br>
http(s), this would be a workaround in the current case.<br>
<br>
We will think about providing Subversion access over https if the<br>
blockers of ports persist.<br>
<br>
Sincerely yours,<br>
Saulius<br>
<br>
On 2020-07-09 17:12, Noel O'Boyle wrote:<br>
> 've been trying to download the COD using the instructions at<br>
> <a href="https://wiki.crystallography.net/howtoobtaincod/" rel="noreferrer" target="_blank">https://wiki.crystallography.net/howtoobtaincod/</a>.<br>
> <br>
> mkdir -p cif; rsync -av --delete rsync://<a href="http://www.crystallography.net/cif/" rel="noreferrer" target="_blank">www.crystallography.net/cif/</a><br>
> <<a href="http://www.crystallography.net/cif/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.crystallography.net/cif/</a>> cif/<br>
> gives:<br>
> rsync: failed to connect to <a href="http://www.crystallography.net" rel="noreferrer" target="_blank">www.crystallography.net</a><br>
> <<a href="http://www.crystallography.net" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.crystallography.net</a>> (193.219.81.210): Connection refused (111)<br>
> rsync error: error in socket IO (code 10) at clientserver.c(125)<br>
> [Receiver=3.1.2]<br>
> <br>
> while<br>
> svn co svn://<a href="http://www.crystallography.net/cod" rel="noreferrer" target="_blank">www.crystallography.net/cod</a><br>
> <<a href="http://www.crystallography.net/cod" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.crystallography.net/cod</a>><br>
> gives:<br>
> <br>
> svn: E000111: Unable to connect to a repository at URL<br>
> 'svn://<a href="http://www.crystallography.net/cod" rel="noreferrer" target="_blank">www.crystallography.net/cod</a> <<a href="http://www.crystallography.net/cod" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.crystallography.net/cod</a>>'<br>
> svn: E000111: Can't connect to host '<a href="http://www.crystallography.net" rel="noreferrer" target="_blank">www.crystallography.net</a><br>
> <<a href="http://www.crystallography.net" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.crystallography.net</a>>': Connection refused<br>
<br>
<br>
<br>
-- <br>
Dr. Saulius Gražulis<br>
Vilnius University Institute of Biotechnology, Saulėtekio al. 7<br>
LT-10257 Vilnius, Lietuva (Lithuania)<br>
fax: (+370-5)-2234367 / phone (office): (+370-5)-2234353<br>
mobile: (+370-684)-49802, (+370-614)-36366<br>
</blockquote></div>